木田余城（茨城県土浦市木田余）は、もと木田余台の「城の内」というところにあったが、小田氏の重臣・信太範宗のときにここに移ったといわれている。

天文二十三年八月（1554・異説あり）信太範宗が謀殺されると、小田氏治（十五代）が代って在城したが、天正六年（1578）佐竹義重の再度の攻撃で落城し、義重城郭を破壊し廃城となったとされる（『城址案内板』）。

常磐線により城跡は二分されているが、本丸があった中城・北堀・南堀・横堀などの地名が残っている。朽木氏土浦城主のとき木田余城跡の堙滅をおそれ、宝積寺を本丸跡に移した。
明治三十六年汽車の飛火より同寺も焼失し、旧本丸跡（本堂跡）は水田中に一部畑地として名残を留めていたが、昭和五十九年十二月電留基地の設置によって失われた（『城址案内板』）。

鬼義重に徹底的に破壊されたので、遺構は全くない。線路脇に水田が広がるのみである。